Flexible Cdocker: Development and Application of a Pseudo-Explicit Structure-Based Docking Method within Charmm
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Detailed analysis of grid-based molecular docking: A case study of CDOCKER - A CHARMm-based MD docking algorithm
The influence of various factors on the accuracy of protein-ligand docking is examined. The factors investigated include the role of a grid representation of protein-ligand interactions, the initial ligand conformation and orientation, the sampling rate of the energy hyper-surface, and the final minimization. A representative docking method is used to study these factors, namely, CDOCKER, a mol...
متن کاملDesigning a novel structure of explicit model predictive control with application in a buck converter system
This paper proposes a novel structure of model predictive control algorithm for piecewise affine systems as a particular class of hybrid systems. Due to the time consuming and computational complexity of online optimization problem in MPC algorithm, the explicit form of MPC which is called Explicit MPC (EMPC) is applied in order to control of buck converter. Since the EMPC solves the optimizati...
متن کاملconstruction and validation of a computerized adaptive translation test (a receptive based study)
آزمون انطباقی رایانه ای (cat) روشی نوین برای سنجش سطح علمی دانش آموزان می باشد. در حقیقت آزمون های رایانه ای با سرعت بالایی به سمت و سوی جایگزین عملی برای آزمون های کاغذی می روند (کینگزبری، هاوسر، 1993). مقاله حاضر به دنبال آزمون انطباقی رایانه ای برای ترجمه می باشد. بدین منظور دو پرسشنامه مشتمل بر 55 تست ترجمه میان 102 آزمودنی و 10 مدرس زبان انگلیسی پخش گردید. پرسشنامه اول میان 102 دانشجوی س...
iranian efl learners’ pragmatic development: a study of proficiency and textbook effect
در تحقیق حاضراین پرسش که آیا دانش کاربرد شناسی زبان آموزان ایرانی همگام با پیشرفت بسندگی زبانی آنها افزایش می یابد مورد مطالعه قرار گرفته و هم چنین به این پرسش که آیا زبان آموزان تعلیم دیده از طریق کتاب های تاپ ناچ و اینترچینج تفاوت معناداری از لحاظ سطح دانش کاربرد شناسی دلرند ، پاسخ داده شده است. در این تحقیق55 فراگیر زبان انگلیسی به عنوان زبان دوم ازطریق نمونه گیری در دسترس مورد مطالعه قرار گ...
application of upfc based on svpwm for power quality improvement
در سالهای اخیر،اختلالات کیفیت توان مهمترین موضوع می باشد که محققان زیادی را برای پیدا کردن راه حلی برای حل آن علاقه مند ساخته است.امروزه کیفیت توان در سیستم قدرت برای مراکز صنعتی،تجاری وکاربردهای بیمارستانی مسئله مهمی می باشد.مشکل ولتاژمثل شرایط افت ولتاژواضافه جریان ناشی از اتصال کوتاه مدار یا وقوع خطا در سیستم بیشتر مورد توجه می باشد. برای مطالعه افت ولتاژ واضافه جریان،محققان زیادی کار کرده ...
15 صفحه اولذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Biophysical Journal
سال: 2014
ISSN: 0006-3495
DOI: 10.1016/j.bpj.2013.11.3576